Az egyéni vállalkozónak lehetősége van arra, hogy a bevételt meghaladó költségeket (elhatárolt veszteség) a következő öt adóév egyéni vállalkozásból származó bevételeivel szemben elszámolja. A kezdés évében és az azt követő három évben keletkezett veszteség korlátlan ideig elhatárolható.

Az adóév elhatárolt veszteségét a korábbi évekről áthozott elhatárolt veszteség figyelembevétele nélkül kell megállapítani, tehát nem kell automatikusan a korábbi évek veszteségét mint költséget figyelembe venni. Ilyen szabályozás 1995 év előtt volt csak érvényben.

Az elhatárolt veszteségek levonásánál a korábbi évekről áthozott veszteségeket kell először figyelembe venni. Ezt a sorrendiséget a tevékenységet kezdő egyéni vállalkozónak is alkalmaznia kell, ami azt jelenti, hogy ha túl sok veszteséget halmoz fel az első három évben, azzal a későbbi évek veszteségének elhatárolását veszélyeztetheti, mivel, ha a kezdést követő három évben keletkezett vesztesége olyan mértékű, hogy későbbi időszakok nyereségével szemben nem tudja érvényesíteni, a következő évek vesztesége nem válik elszámolhatóvá.

Az egyéni vállalkozói tevékenység megkezdése évét követő negyedik évtől abban az évben, amelyben az egyéni vállalkozói bevétel nem éri el az elszámolt költség felét, a veszteséget csak az adóhatóság engedélye alapján határolhatja el.

Az adóhatósági engedély akkor adható meg, ha a veszteség elháríthatatlan külső ok miatt következett be. Az engedélyt kérelemre indult adóigazgatási eljárásban kell előterjeszteni, amely kérelemhez csatolni kell elháríthatatlan külső ok fennállását igazoló iratokat. A kérelmet az adóhatóság határozatban bírálja el.

A mezőgazdasági tevékenység egyik sajátossága, hogy a természeti tényezők is befolyásolják az eredményességét. Erre tekintettel, az európai normák szerint indokolt erre tekintettel a visszamenőleges veszteségelhatárolás megengedése. A személyi jövedelemadó törvény az őstermelő és a mezőgazdasági tevékenységet folytató egyéni vállalkozó számára is a mezőgazdasági tevékenység bevételének arányában a megelőző két év terhére engedi meg.

Ebben a körben az egyéni vállalkozó mezőgazdasági tevékenységének valamennyi olyan tevékenységet kell értelmezni, amelyet az őstermelők körében az szja törvény annak elismer.

Ez azt jelenti, hogy ha több tevékenységből származik az adóévben bevétele a vállalkozónak, meg kell állapítania a mezőgazdasági tevékenység - a veszteség keletkezésének évében mért - bevételét, amelyet arányosítania kell az éves összes bevétellel (mezőgazdasági tevékenység bevétele / éves összes bevétel). Az így kapott arányszám szerint kell a veszteséget tevékenységenként elkülöníteni.

A visszamenőleges veszteség elhatárolás esetében - ha az adófizetési kötelezettség módosításával jár - önellenőrzést arra az adóévre kell benyújtani, amely évre a veszteséget visszamenőleges hatállyal kívánja a vállalkozó elhatárolni.

A tevékenység során keletkezett veszteség nyilvántartását az szja nem írja elő, ennek figyelésére ugyanakkor indokolt nyilvántartást felfektetni, illetve a vállalkozói tevékenységről szóló bevallásrészben erre vonatkozó adatot tájékoztató jelleggel kell megadni.