Az APEH hatásköre tételesen nincs felsorolva. Az Art mindazon adót (pl. személyi jövedelemadó, általános forgalmi adó, társasági adó, osztalékadó, fogyasztási adó, járulékok, stb.), támogatást (pl. mezőgazdasági és élelmiszeripari exporttámogatás, mezőgazdasági gépvásárlási támogatás, agrárpiaci támogatás, fogyasztói árkiegészítés, stb.) és a központi költségvetés terhére garanciavállalás címén kifizetett összegek behajtását ide telepíti, amelyről törvény másként nem rendelkezik. Ide tartozik továbbá a magánnyugdíjpénztári tagdíjjal kapcsolatos ellenőrzés, utólagos adómegállapítás és végrehajtás.

Központi költségvetést megillető vám- és jövedéki követelések tekintetében az APEH csőd- és felszámolási eljárásokban, végelszámolásokban a hitelező képviselőjeként, ingó- és ingatlan végrehajtási eljárásában az APEH a végrehajtás foganatosítójaként jár el. (A vámhatóság tehát vám- és jövedéki biztosítékból rendezheti a vám- és jövedéki tartozásokat és csak azonnali beszedési megbízást nyújthat be)

Helyi adók első fokon az azt bevezető önkormányzati adóhatóság hatáskörébe tartoznak. Ugyancsak az önkormányzati adóhatóság jár el a magánszemélyek adók módjára behajtandó köztartozásainak behajtásánál.

Illetékek kiszabásával, megfizetésével, behajtásával, ellenőrzésével kapcsolatos ügyekben első fokon a fővárosi, megyei önkormányzat főjegyzője jár el - illetékhivatal megjelöléssel.

Az illetékesség általában a székhely, magánszemélynél a lakóhely, ingatlan utáni adó esetében az ingatlan fekvése szerint alakul. Székhely hiányában jogi személyiség nélküli vállalkozónál és egyéni vállalkozónál a telephely szerinti adóhatóság az illetékes.

Magánszemélynél állandó lakóhely hiányában az ideiglenes lakóhely, szokásos tartózkodási hely szerinti adóhatóság jár el. Ha az egyéni vállalkozó telephelye és lakóhelye szerinti illetékessége eltér, személyi jövedelemadó bevallását a vállalkozói bevallásával együtt a telephely szerinti megyében adja le.

Az ingatlan fekvése szerinti illetékesség helyi adóknál, ajándékozási és visszterhes vagyonátruházási illetékeknél fordul elő, az APEH-körbe tartozók közül csak az építőközösségek, társasházközösségek ÁFA visszaigénylési ügyeiben jellemző.

Az állami adóhatóság hatáskörén belül kizárólagos illetékessége van az APEH Észak-Budapesti Igazgatóságának a következő ügyekben:

1. fegyveres erők, rendvédelmi szervek, ezek tagjai és alkalmazottai, APEH alkalmazottak az APEH hatáskörébe tartozó adóügyekben,
2. HM irányítású, felügyeletű szervezetek, HM kizárólagos tulajdonában lévő gazdasági társaságok, kht-k és alkalmazottai,
3. külföldi szervezet, külföldi diplomáciai és konzuli képviseletek, stb. adóügyeiben.

Az adóhatóság eljárása minden szakaszában köteles vizsgálni hatáskörét és illetékességét, s nem járhat el, ha nincs hatásköre, vagy nem illetékes. Ha azonban az illetékességváltás az ellenőrzés megkezdését követően adózó székhely-, telephely-, vagy lakóhely áthelyezésével szűnik meg, az ellenőrzés továbbfolytatására, befejezésére, határozat kiadására az ellenőrzés megkezdésekor illetékes adóhatóság jogosult.

Adózó mindenki, akire az adótörvények, vagy az Art adókötelezettséget írnak elő. Ide tartoznak az adóalanyokon kívül mindazok, akikre az adókötelezettség valamely elemét az említett jogszabályok előírják (például: kifizető, munkáltató, adókedvezményre jogosító igazolást kiállító, stb.). Nem adózó a "mögöttes felelős" (aki más személy adótartozásáért helytállni köteles), de gyakorolhatja az adózót megillető jogokat. A jogutód mindazokat a jogokat gyakorolja, amely a jogelődöt megillette, s teljesíti a jogelőd által nem teljesített kötelezettségeket. Egyes anyagi jogszabályok azonban speciális szabályokat is érvényesítenek.

Adóhatóságok:

1. állami adóhatóság az APEH és szervei.

Első fokon járnak el az APEH Megyei Igazgatóságai, fővárosban az Észak-Budapesti, Dél-Budapesti, illetve Kelet-Budapesti Igazgatósága, illetve Pest megye és a főváros kiemelt adózóinak ügyeiben a Kiemelt Adózók Igazgatósága (APEH-ről szóló, módosított 55/1991. (IV.11.) Korm.rendelet). A Kiemelt Adózók Igazgatósága hatáskörébe csak a legjelentősebb költségvetési kapcsolatokkal rendelkező adózók tartoznak. Ennek értékhatárai 2002-től változtak (Art 7. számú melléklete), és az eltérő üzleti évet választók mindegyike nem kerül be automatikusan. A megyei szervezetek címe, telefonszámai, kirendeltségek, ügyfélszolgálatok adatai: www.apeh.hu/ugy.htm

Másodfokon eljár az Adó- és Pénzügyi Ellenőrzési Hivatal.

1. Vámhatóság a VPOP és szervei.

Első fokon járnak el a vámhivatalok. Jövedéki ügyekben eljáró vámhivatalok felsorolása, adataik:

http://www.vam.hu/data/informaciok/jovedek/11_jovedeki_hivatalok.html

Vámhivatalok felsorolása, adataik Regionális Parancsnokságonként: http://www.vam.hu/data/cimek/cimek_index.html

Másodfokon a Regionális Parancsnokságok járnak el.

1. Önkormányzati adóhatóságként helyi adó ügyekben az önkormányzat jegyzője jár el, másodfokon a megyei (fővárosi) közigazgatási hivatal.
2. Illetékügyekben első fokon a megyékben, fővárosban - a főjegyző hatósága alatt működő - illetékhivatalok járnak el, másodfokon a megyei (fővárosi) közigazgatási hivatal.

Az adóztatás felügyeletét, adóhatóságok irányításának ellenőrzését a pénzügyminiszter látja el. E hatáskörében konkrét adóügyeket is megvizsgálhat. Jogértelmezési kérdésekben az adóhatóságokra kötelező iránymutatást adhat.